北京大学邓明华教授学术报告

发布日期:2023-10-27    浏览次数:

报告题目:单细胞类型标注中的新类发现

报告人:邓明华

报告时间:2023年11月05日10:00-12:00

报告地点:88038威尼斯4号楼A408

邀请单位:88038威尼斯,福建省应用数学中心(威尼斯登录入口welcome)

报告内容简介:细胞类型标注,即将细胞类型标签从一个已知类型源数据中迁移到目标数据中,是单细胞数据分析中的基本问题。目标数据中往往会含有一些源数据中没有的新细胞类型,如何将其识别出来对于生物发现尤为重要。本报告将给大家汇报课题组最近开发的两个与新类发现相关的算法scEMAIL、scGAD, 重点介绍scEMAIL。scEMAIL利用模型对目标数据样本预测的均一性、可靠性和可重复性进行新类发现,同时scEMAIL采用预训练方式训练源数据,放松了对源数据的依赖,做到了source-free。scGAD利用互近邻锚点信息实现源数据和目标数据的对齐,从而将新类发现和聚类任务统一在一起。

报告人简介:邓明华现任北京大学数学科学学院教授。1987年9月-1998年1月在北京大学数学学院学习,毕业后留校工作至今。2003年8月晋升为副教授,2006年任博士生导师,2009年8月晋升为教授。其间2001年2月-2003年8月在美国南加州大学计算分子生物学中心从事博士后研究,2009年8月-2010年1月美国耶鲁大学访问副教授。邓明华从事生物信息学研究,发表SCI论文90余篇。曾先后主持6项自然科学基金面上项目和1项863项目,参加3项973项目和2项科技部重点研发项目。